ХШУС нь магистрын 11 сургалтын хөтөлбөр хэрэгжүүлдэг.
- Химийн инженерчлэл
- Химийн боловсруулалтын технологи
- Нүүрсний боловсруулалтын технологи
- Газрын тосны боловсруулалтын технологи
- Ховор ба үнэт металлын химийн технологи
- Хүрээлэн буй орчны инженерчлэл
- Материал судлал, инженерчлэл
- Хэрэглээний физик
- Хэрэглээний математик
- Системийн динамик загварчлал
- Математик загварчлал
