ХШУС нь нийт 14 бакалаврын сургалтын хөтөлбөр хэрэгжүүлж байгаагийн 4 нь БНХАУ-ын их сургуулиудтай хамтарсан хөтөлбөр юм. 2026-2027 оны хичээлийн жилээс Япон улсын Кумамото их сургуультай хамтарсан "Хэрэглээний математик" 2.5+2 хөтөлбөрийг хэрэгжүүлэхээр ажиллаж байна.
- Статистик
- Статистик, БНХАУ-тай хамтарсан 2+2
- Статистик (Эхний 2 жил Герман хэлээр)
- Хэрэглээний математик, Япон улстай хамтарсан 2.5+2
- Химийн инженерчлэл
- Химийн инженерчлэл, БНХАУ-тай хамтарсан 2+2
- Химийн боловсруулалтын технологи
- Газрын тосны боловсруулалтын технологи
- Газрын тосны боловсруулалтын технологи, БНХАУ-тай хамтарсан 2+2
- Нүүрсний боловсруулалтын технологи
- Материал судлал, инженерчлэл
- Хэрэглээний физик
- Хүрээлэн буй орчны инженерчлэл
- Хүрээлэн буй орчны инженерчлэл, БНХАУ-тай хамтарсан 2+2
- Наношинжлэх ухаан, инженерчлэл
